Setelah munculnya Gojira baru (Godzilla), pemerintah Jepang membangun Godzilla robot dari tulang-belulang monster asli yang menyerang Tokyo pada tahun 1954 untuk menghentikan binatang itu.

Empat puluh dua tahun setelah kunjungan pertamanya di Tokyo, Mothra kembali untuk memperingatkan umat manusia bahwa mereka harus mengembalikan Mechagodzilla, bersama dengan tulang Godzilla, ke laut, karena orang mati tidak…